女性卵巢 发育和黄体缺陷：卵泡期内分泌失调可导致促卵泡激素缺乏，卵泡发育影响黄体功能发育。成熟后促性腺激素分泌峰值低于平均分泌量，导致黄体功能下降，造成黄体发育不良。

子宫内膜异位症：患者腹腔积液明显增多，影响卵泡成熟，导致黄体功能不全。

身体发育不良，卵泡颗粒细胞黄体化不良：卵泡颗粒细胞功能和数量缺失，导致孕酮分泌不足，排卵后颗粒细胞黄体化不完善。

高催乳素血症：抑制垂体促性腺激素的分泌，使其直接作用于卵巢，导致卵泡发育不良或黄体发育不良。

其他：黄体功能不足可能是由于排卵反应不足、雄激素水平过高等引起的单侧药物。